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依主要傳染途徑分類
蟲媒傳染
| 登革熱 | 屈公病 | 瘧疾 |
| 日本腦炎 | 鼠疫 | 恙蟲病 |
| 西尼羅熱 | 地方性斑疹傷寒 | 流行性斑疹傷寒 |
| 萊姆病 | 黃熱病 | 茲卡病毒感染症 |
| 裂谷熱 | 發熱伴血小板減少綜合症 | 淋巴絲蟲病 |
食物或飲水傳染
| 腸病毒感染併發重症 | 腸道出血性大腸桿菌感染症 | 傷寒 |
| 副傷寒 | 沙門氏菌感染症 | 桿菌性痢疾 |
| 阿米巴性痢疾 | 霍亂 | 肉毒桿菌中毒 |
| 庫賈氏病 | 病毒性腸胃炎 | 細菌性腸胃炎 |
| 急性病毒性Ａ型肝炎 | 急性病毒性Ｅ型肝炎 | 小兒麻痺症/急性無力肢體麻痺 |
| 弓形蟲感染症 | 李斯特菌症 | 布氏桿菌病 |
| 第二型豬鏈球菌感染症 | 常見腸道寄生蟲病簡介 | 中華肝吸蟲感染症 |
| 旋毛蟲感染症 | 肺吸蟲感染症 | 廣東住血線蟲感染症 |
| 人芽囊原蟲感染 |
空氣或飛沫傳染
| 新型A型流感 | 水痘併發症 | 結核病 |
| 多重抗藥性結核病 | 流感 | 中東呼吸症候群冠狀病毒感染症 |
| 嚴重急性呼吸道症候群 | 麻疹 | 德國麻疹 |
| 先天性德國麻疹症候群 | 流行性腮腺炎 | 白喉 |
| 百日咳 | 侵襲性肺炎鏈球菌感染症 | 侵襲性ｂ型嗜血桿菌感染症 |
| 流行性腦脊髓膜炎 | 退伍軍人病 | 天花 |
| 漢他病毒症候群 | 肺囊蟲肺炎 | 隱球菌症 |
| Ｑ熱 | 鸚鵡熱 |
性接觸或血液傳染
| 人類免疫缺乏病毒感染 | 梅毒 | 淋病 |
| 急性病毒性Ｂ型肝炎 | 急性病毒性Ｃ型肝炎 | 急性病毒性Ｄ型肝炎 |
接觸傳染
| 福氏內格里阿米巴腦膜腦炎 | 狂犬病 | 炭疽病 |
| 類鼻疽 | 鉤端螺旋體病 | 破傷風 |
| 新生兒破傷風 | 疥瘡感染症 | 頭蝨感染症 |
| 漢生病 | 貓抓病 | 兔熱病 |
| 疱疹B病毒感染症 | 亨德拉病毒及立百病毒感染症 | 拉薩熱 |
| 馬堡病毒出血熱 | 伊波拉病毒感染 |
其他類
| 棘狀阿米巴 | NDM-1腸道菌感染症 | CRE抗藥性檢測 |
| VISA/VRSA抗藥性檢測 |
詳細資料請參閱 衛生福利部疾病管制署
